遗传性疾病致病基因变异智能分析系统
概述
寻找意向单位开展技术研发合作。血友病 A(Hemophilia A,HA)是 X 染色体连锁的隐性遗传性出血性疾病,一般为男性发病,女性携带,发病率为 1/5000。临床表现主要为不同程度、不同部位的出血。HA 是由 FⅧ基因突变导致,约半数重型血友病A 是由内含子 22 倒位(intron 22 inversion,Inv22)及内含子 1 倒位(intron 1 inversion,Inv1)所致。明确 HA 患者的基因突变类型对其临床决策、家庭管理以及个体化治疗具有重大意义。
需求详情
1.核心需求描述寻找意向单位开展技术研发合作。血友病 A(Hemophilia A,HA)是 X 染色体连锁的隐性遗传性出血性疾病,一般为男性发病,女性携带,发病率为 1/5000。临床表现主要为不同程度、不同部位的出血。HA 是由 FⅧ基因突变导致,约半数重型血友病A 是由内含子22倒位(intron 22 inversion,Inv22)及内含子1倒位(intron 1 inversion,Inv1)所致。明确 HA 患者的基因突变类型对其临床决策、家庭管理以及个体化治疗具有重大意义。脆性X染色体综合征是一种发病率仅次于先天愚型的遗传性智能低下综合征,呈不完全外显性X连锁显性遗传病,其致病基因为FMR1,编码脆性X智力残疾基因蛋白(FMRP),FMR1基因突变是智力残疾的主要因素之一,其外显率因性别不同有差异,男性80%,女性30%。95%以上的脆性X染色体综合征患者发病的分子遗传学基础是FMR1基因(CGG)n结构扩展的动态突变引起的,约5%以下则是由于FMR1基因的错义突变和缺失型突变影响了FMRP的正常结构导致的。脆性X染色体综合征发病率高,临床表现复杂,遗传规律明确。目前无有效的治疗方法,要降低其发病率,关键是查出携带者及病人,然后通过遗传咨询、产前诊新、阻止患儿出生。目前F8基因与FRM1基因检测都无法使用NGS技术进行检测,为了用尽可能少的检测体系完成更全面的检测,从而达到有效地降低成本、减轻工作量、尽快给予患者检测结果的目的,选择常规PCR技术来进行样本检测最为合适,但目前开发的PCR检测技术往往由各研发实验室独立开发,开发过程往往依赖实验室现有设备,因此技术有较强的设备依赖性,检测精密度和灵敏度难以达到LDT临床检测的要求,因此亟需对PCR检测方案进行优化,提升其检测的稳定性和设备普适性,以便于更好的推广检测试剂和方案。2.研发成果简介目前,Liu等在1998年使用长距离PCR(long-distance polymerase chain reaction,LD-PCR)对Inv22进行检测,扩增体系直接以基因组DNA为模板,包含 P、Q、A、B四条引物。同年,刘敬忠等对上述 LD-PCR中引物进行优化,该研究团队分别使用PQAB,PQA以及PQB三组不同引物配比进行研究,结果显示使用三组引物均能成功检测 Inv22,并能区分患者家系成员是否为携带者。2006年,BAGNALL等设计了四条引物,分别为H1F、H2F、H3F、H1R,其序列完全不同于PQAB,该引物组合可以区分Inv22的重组基因型(Ⅰ型或Ⅱ型)。基于以上几篇文献,本公司建立了F8基因22号内含子倒位和1号内含子倒位的快速筛选体系,单个样本分别使用22号内含子扩增液和1号内含子扩增液进行PCR扩增,取扩增后的PCR产物进行琼脂糖凝胶电泳,通过电泳条带大小来判断样本是正常人、携带者还是患者。目前基于PCR技术的F8基因检测技术处在研发优化阶段,因为在实际样本检测过程中发现试剂PCR检测存在严重的仪器依赖性,即该试剂的适用机型范围较窄(仅在艾本德Mastercycler设备中能正常扩增检测),在后期实验应用中受限较大,不利于技术推广。目前我们在针对该问题设计了一系列的优化与测试,通过调整扩增体系和扩增程序来稳定试剂的检测性能,并同时在不同PCR扩增设备上进行测试,保证试剂的准确性和特异性达到100%,灵敏度不高于10 ng/μL。在研发投入这块,目前已投入研发设备有PCR扩增仪4台(不同型号)、电泳设备1套、研发人员3名、同时还购买了目前市场上的拥有三类注册证的F8基因检测试剂盒作为对标试剂,目前共计投入31.2万元。 目前基于PCR技术的F8基因检测技术已经在艾本德Mastercycler设备上实现F8基因22号内含子倒位和1号内含子倒位的准确检测,基于PCR技术的FRM1基因检测技术目前已完成方案方案的开发与设计,后期计划选取临床样本对试剂的性能指标进行测试与验证。血友病作为罕见病的一种,其实患者数目不在少数,据调查,在男性人群中,血友病A的发病率约为1/5000,血友病B的发病率约为1/25000,仅在法、德、意、西班牙和英国这欧盟五国及美国,大约有39000名血友病A患者和10000名血友病B患者,目前尚无有效的根治方法,患者主要输注F8制品或新鲜全血预防和治疗出血。由于HA的危害性、遗传性及终生性,有必要开展HA的基因诊断、携带者检测及产前诊断,为临床干预和家系女性成员生育指导提供依据,目前本公司每月会有数十例F8基因的检测需求。脆性X综合征是一种累及多个系统的神经发育障碍性疾病,主要特征包括智力障碍、孤独症样行为、长脸、大耳朵、青春期巨睾等。其发病率男性约为1/5000、女性约为1/4000~1/8000,目前尚无美国食品药品监督管理局批准的FXS治疗方法,公司每月大约有200例FRM1基因检测需求。根据目前实际情况我们开发一款性能稳定、价格低廉的检测试剂需求就很强烈。3.对揭榜方要求揭榜机构要求有PCR试剂开发的经验和成功案例,需要提供相关证明材料(文章,专利,委托合同等)。研发团队有独立的实验室和5人以上的研发团队,有自主研发经验,在分子检测试剂盒方面具有丰富的试剂开发经验,可根据检测需要调整试剂反应体系及程序,具备良好的信誉,项目交付能力。
技术参数
产权归属、利益分配等要求福君基因提供检测试剂盒的sop,委托开发方解决试剂盒稳定性和设备普适性的瓶颈问题。试剂盒sop及优化的实验方案的知识产权100%归福君所有。如委托开发过程中采用揭榜方的专利知识产权及技术,产权归属及比例经双方协商后确定。
已过期:截止至2023-10-31
金额:18万元-20万元