基于拓扑感知注意力网络的蛋白质功能预测方法及装置

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基于拓扑感知注意力网络的蛋白质功能预测方法及装置
申请号:CN202410802421
申请日期:2024-06-20
公开号:CN118711672A
公开日期:2024-09-27
类型:发明专利
摘要
本发明提出了一种基于拓扑感知注意力网络的蛋白质功能预测方法及装置,其中的方法包括如下步骤S1:获取公开蛋白质功能注释数据集、公开的描述基因本体及关系obo文件;S2:构建蛋白质图输入和基因本体图输入;S3:搭建基于拓扑感知的蛋白质‑基因本体论注意力网络,其中包括拓扑感知的注意力模块和多头聚合器;S4:利用步骤S1中的数据对步骤S3中的拓扑感知的蛋白质‑基因本体注意力网络进行训练,得到训练好的蛋白质功能预测模型。S5:对待一个待预测功能的蛋白质,利用步骤S5中的训练好的模型生成其被每一个GO术语注释的概率。通过本发明的方法可以提升蛋白质功能预测的效果。
技术关键词
蛋白质功能预测方法 术语 基因 本体论 网络 节点特征 语义 蛋白质结构预测 Softmax函数 模型训练模块 关系 数据获取模块 搭建模块 处理器 注意力机制 预测装置