一种用于预测肉牛采食量的瘤胃微生物标志物及其筛选方法
申请号:CN202410975998
申请日期:2024-07-19
公开号:CN118792427A
公开日期:2024-10-18
类型:发明专利
摘要
本申请涉及一种用于预测肉牛采食量的瘤胃微生物标志物及其筛选方法,涉及微生物技术领域;微生物标志物至少包含如下的微生物之一或其任意组合:Rikenellaceae RC9、Eubacterium coprostanoligenes、NK4A214、Ruminococcus、Christensenellaceae R‑7group、Papillibacter和SP3‑e08,其中NK4A214、Christensenellaceae R‑7group、Papillibacter准确性较高,其与RFI呈显著负相关;其筛选方法通过16SrRNA高通量测序技术对肉牛瘤胃微生物属水平和ASV代表序列进行分类学分析,获得属和ASV在分类水平和相对丰度,通过机器学习算法,找出预测动物剩余采食量得生物标志物,并通过宏基因组注释进行功能验证;筛选方法准确率高,筛选得到的微生物标志物准确度较高,能够准确预测肉牛剩余采食量,能够提前对LRFI肉牛进行筛选,为肉牛的选育带来便利,提高肉牛的养殖效益。
技术关键词
瘤胃微生物
标志物筛选方法
微生物共生
纯化DNA片段
随机森林模型
高通量测序方法
样本
琼脂糖凝胶电泳
16SrRNA基因
高通量测序技术
模块化特征
扩增子
网络集线器
训练集
朴素贝叶斯
肉牛饲养
引物