基于原始电流和注意力模型的Nanopore测序数据纠错方法

本发明公开了一种基于原始电流和注意力模型的Nanopore测序数据纠错方法。本发明包含以下步骤：首先，根据Nanopore原始测序数据进行比对后，获取Nanopore原始测序数据中所有碱基序列的错误碱基信息和正确碱基信息；结合滑动窗口对所有碱基序列进行特征提取后，获得各碱基序列对应的错误碱基特征集合，进而构建训练样本集；接着训练并获得不同模式的预测模型，最后对待测碱基序列预处理后再输入到预测模型并获得预测结果，根据获得的预测结果对待测碱基序列纠正。本发明通过引入Transformer模型对纳米孔测序数据进行纠错，充分利用原始电流信号中的信息，提升测序数据的准确性和可靠性。