一种海洋浮游生物高通量测序信息的整合和优化处理方法
申请号:CN202411085502
申请日期:2024-08-08
公开号:CN119028433A
公开日期:2024-11-26
类型:发明专利
摘要
本发明提供了一种海洋浮游生物高通量测序信息的整合和优化处理方法,属于生物信息学和海洋生物学技术领域。该方法包括以下步骤:使用Trimmomatic软件对原始测序数据进行质量控制;采用DADA2算法去除测序误差;利用PEAR工具进行序列拼接,使用SPAdes软件进行序列组装;使用DIAMOND工具和SILVA数据库进行功能注释和分类注释;使用CD‑HIT工具整合多次测序结果,构建非冗余序列库;使用QIIME2软件进行α多样性和β多样性分析,并结合R语言和Python生成多样性分析图表和共现网络图。该方法提高了数据处理的准确性和效率,为海洋浮游生物多样性和群落结构研究提供了重要支持。
技术关键词
海洋浮游生物
高通量
序列
原始测序数据
海洋生物学技术
16SrRNA基因
软件
样本
图表
去噪算法
群落结构
指数
控制工具
冗余
误差
网络
核心