一种基于图神经网络的基因交互关系预测方法和装置

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一种基于图神经网络的基因交互关系预测方法和装置
申请号:CN202411615490
申请日期:2024-11-13
公开号:CN119626324B
公开日期:2025-09-19
类型:发明专利
摘要
一种基于图神经网络的基因交互关系预测方法和装置,该方法包括:每个实验组的转录表达数据进行预处理,包括标准化基因ID,将不同实验组的基因转录表达数据以统一的基因ID表示;得到作为后续分析的原始数据;按照每个样本组进行基因相似度的计算,获取样本组中基因与基因之间的相似度数据;通过对所有样本组的数据进行统计和筛选,选取符合设定条件的基因对,作为构建图数据结构的基础;进一步对原始数据进行处理,保证所有样本组中仅包含图结构中定义的基因;随后,对这些样本组的数据进行标准化处理,使得所有样本组的数据维度一致;对上述生成的图数据组进行模型训练,最终得到图结构中的边权重数据,能够准确反映基因之间的交互关系。本发明可用于基因表达数据的分析,预测基因之间的交互关系,并能够在没有标签数据的情况下进行无监督学习。
技术关键词
关系预测方法 基因表达数据 样本 神经网络模型训练 基因表达特征 节点特征 数据格式 度计算方法 无监督学习 测序技术 统计特征 注意力机制 特征选择 预测装置 成分分析 处理器
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