一种基于有向图注意力网络的因果基因调控网络推断方法
申请号:CN202411821353
申请日期:2024-12-11
公开号:CN119294531B
公开日期:2025-03-14
类型:发明专利
摘要
本发明公开一种基于有向图注意力网络的因果基因调控网络推断方法,属于图表示学习、系统生物学技术领域。本发明利用先验调控信息构建初始的有向因果图,并以表达数据作为图中节点的初始特征,然后,利用两个有向图注意力网络分别学习基因在有向因果图中作为源节点和目标节点的嵌入表示,同时使用残差网络学习表达数据中隐含的基因自身的特征信息;最后,基于基因的转录因子嵌入、靶基因嵌入以及自身嵌入来计算潜在有向调控关系的概率。本发明从有向调控关系的角度来学习并建模基因调控网络,提升了潜在有向调控关系的推断准确性。
技术关键词
基因调控网络
残差网络
推断方法
转录因子
系统生物学技术
邻域
源节点
身份
前馈神经网络
关系
工作特征
注意力机制
数据
定义
计算方法
单层