一种基于图神经网络的miRNA-疾病关联预测方法

本发明提供了一种基于图神经网络的miRNA‑疾病关联预测方法，涉及图神经网络技术领域。该方法包括：获取miRNA序列、疾病描述文本、miRNA家族信息、疾病父子关系和miRNA‑疾病关联关系数据，进行数据对齐后构建异质图；基于miRNA序列和疾病描述文本，使用预训练语言模型获取miRNA表示和疾病表示作为节点特征，更新异质图；构建异质图MDA关联预测模型，将更新后的异质图和待预测miRNA‑疾病对输入，得到待预测miRNA‑疾病对的关联预测分数。该方法在实体表示上可充分表示生物实体；在模型构建上可有效聚合不同类型节点的信息，并在不同类型的边执行多深度的消息传递，实现对节点、边的异构信息的整合，有助于提升miRNA‑疾病关联预测性能。