一种基于贝叶斯优化的高特异性基因/位点组合的筛选方法
申请号:CN202510044523
申请日期:2025-01-11
公开号:CN120015128A
公开日期:2025-05-16
类型:发明专利
摘要
本发明公开了一种基于贝叶斯优化的基因/位点组合的筛选方法,利用高斯过程模型筛选样本类型特异性最高的基因/位点组合,高斯过程模型的核函数为双因素垂直交联核,包含基础变异和离散变异两个核心,以相同样本类型中的差异为基础,以不同样本类型之间的离散程度为辅助项,用于计算两个基因/位点组合之间的关系。本发明所述的方法可对不同的基因/位点组合中的每一个基因/位点在相同样本类型和不同样本类型中的相关性进行评价,将生物学上所需的基因/位点特征充分融入到基因/位点筛选的过程中,显著提高计算性基因/位点筛选的高效性、特异性和准确性,同时显著增加基因/位点筛选的数量上限。
技术关键词
位点
样本
协方差矩阵
表观遗传修饰
神经网络模型
DNA拷贝数变异
退行性骨关节疾病
筛选方法
蛋白质表达水平
蛋白质表达谱
编码
代谢组学数据
单核苷酸多态性
血液系统疾病
差异表达基因