融合完全动态卷积与CubeMLP的植物转录因子结合位点预测方法
申请号:CN202510066044
申请日期:2025-01-16
公开号:CN120148607A
公开日期:2025-06-13
类型:发明专利
摘要
本发明提供了融合完全动态卷积与CubeMLP的植物转录因子结合位点预测方法,通过将测序得到的植物转录因子结合位点区域的DNA序列数据进行One‑hot编码处理和DNA双螺旋的空间结构特征提取;利用ODConv网络动态提取不同类别TFBS序列的模式特征,利用卷积神经网络提取DNA空间结构特征;利用CubeMLP从序列、模态和通道三个维度实现DNA序列特征模态和DNA空间结构模态特征的高效融合;利用全连接层和Sigmoid函数将融合特征的结果映射为不同类别的转录因子结合位点,进而实现不同类别转录因子绑定位点的识别;实现了预测转录因子结合位点的功能。本发明预测准确率高,为植物的转录因子的识别位点研究了提供新参考,具有广泛的应用前景。
技术关键词
位点预测方法
转录因子
DNA序列特征
动态卷积网络
蒙特卡洛模拟方法
编码
多层感知机
融合特征
空间结构特征提取
矩阵
模态特征
卷积神经网络提取
注意力机制