用于AML诊断的易感SNP位点靶标基因的筛选方法及其应用

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用于AML诊断的易感SNP位点靶标基因的筛选方法及其应用
申请号:CN202510116879
申请日期:2025-01-24
公开号:CN119580833B
公开日期:2025-05-27
类型:发明专利
摘要
本发明涉及生物技术领域,提供一种用于AML诊断的易感SNP位点靶标基因的筛选方法及其应用,方法包括:获取AML易感SNP位点、三维基因组数据以及AML病人队列数据;对三维基因组数据进行预处理,获得DNA相互作用区段;根据DNA相互作用区段预测AML易感SNP位点调控的潜在靶标基因;根据AML易感SNP位点调控的潜在靶标基因,筛选高可信度的转录调控靶标基因,获得高可信度的靶标基因集;运用体外细胞实验验证高可信度的靶标基因集的SNP的转录调控活性。本发明拓展了对于AML易感SNP与靶标基因之间调控网络的理解,提供了新的生物标志物和药物靶点。
技术关键词
靶标 位点 筛选方法 线性回归模型 突变等位基因 转录调控活性 数据 队列 因子 染色体 生物标志物 成分分析 细胞系 启动子 关系 样本 表达式 定义