一种基于集成学习的短肽毒性预测方法

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一种基于集成学习的短肽毒性预测方法
申请号:CN202510156953
申请日期:2025-02-13
公开号:CN119943157A
公开日期:2025-05-06
类型:发明专利
摘要
本发明涉及一种基于集成学习的短肽毒性预测方法,属于生物信息学和食品安全领域。针对传统短肽毒性评估方法耗时长、成本高及现有计算方法对短肽(≤25个氨基酸)预测精度不足的技术问题,提出一种基于多算法集成的TasToxPred预测模型。该模型通过整合20种序列编码描述符构建多维特征表征体系,采用9种机器学习算法的动态权重配置机制进行集成预测,实现了对短肽毒性的精确评估。应用该方法在独立测试集上实现了0.7019的Matthews相关系数(MCC)和0.8445的准确率,通过CCK‑8细胞毒性实验和溶血活性测定对73个预测为无毒的短肽进行验证,结果显示在100μM浓度下细胞存活率均保持在90%以上,溶血率低于1.5%,充分验证了模型预测的可靠性,可广泛应用于功能性短肽的安全性评估和开发筛选。
技术关键词
毒性预测方法 学习系统 描述符 数据整合系统 序列特征 物理化学特征 基础分类器 专业数据库 二肽 模型训练模块 机器学习算法 特征提取模块 工程系统 编码特征 特征工程 K近邻 随机森林 策略