一种基于寡核苷酸探针序列多特征的模型

本发明提供一种基于寡核苷酸探针序列多特征的模型，属于分子生物学技术领域；包括以下步骤：S1、探针设计：在DNA微阵列芯片上排列有25nt长度的寡核苷酸探针；S2、特征提取：针对每个寡核苷酸探针序列，提取多个特征参数，特征参数包括GC含量、二级结构倾向、热力学稳定性、序列复杂性、碱基堆积能，共计五个特征；S3、模型构建：基于所提取的五个特征，利用机器学习算法构建预测模型；S4、信号预测：将模型应用于新的寡核苷酸探针序列，预测其在杂交过程中产生的荧光信号强度。本发明通过用寡核苷酸探针的5个特征，共同用于模型的构建，实现了DNA微阵列芯片探针设计的闭环优化，提高探针设计的效率，降低测试生产成本。