基于基因关系网络及药物亚结构的药物反应预测方法

本发明提供了基于基因关系网络及药物亚结构的药物反应预测方法，包括如下步骤：采用增强图注意力网络对细胞系的基因表达、拷贝数变异、突变的三种多模态特征进行特征提取；使用门控消息传递神经网络获取药物的亚结构，通过增强图注意力网络提取特征；构建原子‑键图以及键‑角图这两个互补的图结构，使用图卷积神经网络对两个图进行特征提取以及消息传递，进而提取药物3D特征；通过concat操作整合药物以及细胞系的特征，通过mlp进行药物反应预测。本发明提供的药物反应预测方法通过建使用三种不同侧重的组学数据提取细胞系特征，使用药物分子图、药物3D结构、药物分子指纹以及药物亚结构关系进行药物特征提取。