摘要
本发明提出了多器官单细胞测序数据整合方法，所述方法包括：S1：数据预处理，包括数据采集和数据清洗两个部分，对每个单细胞测序数据集进行归一化、缩放和特征选择操作；S2：数据降维和数据聚类，针对每个器官数据集，采用scanpy包中的PCA和Leiden方法，选择前40个主成分进行降维聚类；S3：构建重合度矩阵，对于每个器官，构建自身与其他器官的重合度矩阵，将所述重合度矩阵输入到粒子群算法中；S4：结合粒子群算法，对多个器官的数据进行批次效应校正。对于相同细胞类型的数据不同器官，粒子群优化算法在不改变原始数据结构的情况下，寻求全局最优标度指数，充分展示不同器官数据的异质性和同质性，为下游实验和分析提供良好的集成数据集。
