一种基于图注意力网络的多肽设计方法

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一种基于图注意力网络的多肽设计方法
申请号:CN202510353094
申请日期:2025-03-25
公开号:CN120220792A
公开日期:2025-06-27
类型:发明专利
摘要
本发明提出一种基于图注意力网络的靶向蛋白多肽设计方法,旨在解决传统方法效率低、成功率不足的问题,包括:从RCSB数据库中构建包含53,717对蛋白互作的数据集,通过特征建模将蛋白质表面原子转化为图结构;进而设计层次化图注意力网络,采用多头注意力机制与动态边卷积的复合模块,通过双任务联合训练策略:热点预测和相互作用预测,实现精准识别结合界面;预测阶段通过多尺度表面特征计算、热点区域筛选及比对,从88,204个α螺旋多肽库中筛选候选序列,经Rosetta能量优化和三维可视化验证,以解决实际应用中蛋白质设计成功率不足的技术问题。
技术关键词
蛋白多肽 热点区域筛选 双任务模型 复合模块 网络 多尺度特征提取 多头注意力机制 复合物结构 热力图 动态 优化器 水性 种子 量表