面向靶点设计药物分子的神经网络模型的构建方法和装置

本发明公开了面向靶点设计药物分子的神经网络模型的构建方法和装置。本发明在原子、残基和残基间三个层次对靶点口袋进行特征化，从而更全面地考虑了靶点的信息；以化学结构逆合成分裂算法得到的分子片段为单位，对药物分子进行特征化和生成，生成的分子具有更高的成药潜力；本发明设计的模型由两个神经网络编码器和一个门控自注意力解码器构成，编码器用于提取靶点和配体分子的特征，解码器实现两种特征的关联并生成分子片段概率，模型可面向特定靶点有效设计药物分子。本发明构建的模型设计出的分子，平均合成可及性得分达到0.769，平均类药性得分达到0.607，高于基线模型PMDM。