基于联合Q学习优化元路径的药物靶标相互作用预测方法

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基于联合Q学习优化元路径的药物靶标相互作用预测方法
申请号:CN202510435035
申请日期:2025-04-08
公开号:CN120299506A
公开日期:2025-07-11
类型:发明专利
摘要
本发明公开了一种基于联合Q学习优化元路径的药物靶标相互作用预测方法,先整合来自不同来源的生物相互作用数据,构建异质信息网络,并学习药物结构特征和蛋白质序列特征;然后使用联合Q学习算法进行元路径的联合优化,得到最优元路径集合;接着节点表示学习,包括构建元路径子图、采用高阶图卷积神经网络和改进的Vanilla图卷积神经网络处理不同深度的元路径子图,通过注意力机制融合不同元路径学到的节点表示特征;最后将节点特征中的药物特征与靶标特征进行拼接,送入全连接神经网络计算相互作用概率,形成最终的药物靶标相互作用预测模型并用于预测。本发明充分利用节点信息,显著提升子图表示能力,提升方法的适应性和效率。
技术关键词
异质信息网络 药物 靶标相互作用 序列特征 Q学习算法 紧凑特征 特征抽取方法 节点特征 注意力机制 多层感知机 疾病 超参数 样本 矩阵 定义 生物