用于二岐性状的全基因组关联分析方法、装置及介质

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用于二岐性状的全基因组关联分析方法、装置及介质
申请号:CN202510465150
申请日期:2025-04-14
公开号:CN120526837A
公开日期:2025-08-22
类型:发明专利
摘要
本申请公开了一种用于二岐性状的全基因组关联分析方法、装置及介质,其方法包括:构建广义线性混合GLMM全模型,其表征了分析对象的数量性状基因座QTL的加性效应、QTL之间的加加上位性效应及QTL与环境之间的互作效应;构建标准化基因型矩阵,包括加性效应标准化系数矩阵和加加上位性效应标准化系数矩阵;进行QTL的关联分析以获取显著加性QTL和显著上位性QTLs对;构建广义线性混合QTL全模型,采用平均信息量限制性最大似然估计迭代方法进行求解,估算QTL的各项效应参数。本申请简化了计算过程,提高了计算效率;能够更全面地挖掘与性状相关的遗传变异位点;且兼具了精确检验的准确性和近似检验的快速性。
技术关键词
效应 关联分析方法 广义 数量性状基因座 变量 线性 迭代方法 位点 参数 关联分析装置 协方差矩阵 迭代算法 可读存储介质 拉普拉斯 分析单元 对象 计算机 元素