一种利用图注意力网络基于空间图网络和细胞通信网络的生物切片对齐的方法

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一种利用图注意力网络基于空间图网络和细胞通信网络的生物切片对齐的方法
申请号:CN202510490323
申请日期:2025-04-18
公开号:CN120411963A
公开日期:2025-08-01
类型:发明专利
摘要
本发明涉及生物信息学及计算生物学领域,尤其涉及一种利用图注意力网络的基于生物切片的空间图网络和细胞通信网络以实现生物切片精确对齐的方法。其发明内容主要包括:(1)采集目标组织或脑区(如DLPFC)的高分辨率生物切片图像及空间转录组数据,并进行标准化处理;(2)基于细胞空间分布构建空间图网络,并利用配体‑受体数据库构建细胞通信网络;(3)采用GAT进行特征融合和深度学习训练,提取高维特征,同时设计融合均方误差和基于MNN的三元组损失的综合损失函数;(4)通过差分进化算法全局优化旋转、平移及X轴翻转参数,实现切片精准对齐,并以一致性指数评估对齐效果。
技术关键词
通信网络 生物切片图像 深度学习训练 进化优化算法 三元组 进化算法 空间坐标信息 指数 矩阵 后续切片 自动编码器 正则化参数 邻居 数据 注意力机制