基于纳米孔测序的染色质相互作用智能预测方法及系统

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基于纳米孔测序的染色质相互作用智能预测方法及系统
申请号:CN202510638376
申请日期:2025-05-19
公开号:CN120496629A
公开日期:2025-08-15
类型:发明专利
摘要
本发明公开了一种基于纳米孔测序的染色质相互作用智能预测方法及系统,包括:构建染色质环正负样本;对构建的染色质环正负样本提取生成甲基化特征,根据甲基化特征通过初步预测得到初步概率;根据染色质环正负样本提取、编码得到序列矩阵,将序列矩阵和反向互补的序列矩阵分别切分,得到子矩阵集合,根据子矩阵集合通过卷积神经网络提取得到序列特征;最后根据甲基化特征、初步概率、序列特征和距离特征拼接输入回归器,生成预测锚点对形成染色质环的最终概率。本发明解决了现有染色质的相互作用的预测方法成本昂贵、效率低,适用范围有限,无法直接从TGS数据中预测的问题。
技术关键词
染色质相互作用 智能预测方法 纳米孔 序列特征 矩阵 样本 皮尔逊相关系数 XGBoost模型 DNA序列 卷积神经网络提取 智能预测系统 积层 滑动窗口 模块 锚点 编码 数据 位点 元素