一种适用于植物根尖单细胞空间转录组三维重构的方法

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一种适用于植物根尖单细胞空间转录组三维重构的方法
申请号:CN202510708910
申请日期:2025-05-29
公开号:CN120808880A
公开日期:2025-10-17
类型:发明专利
摘要
本发明提供植物根尖单细胞空间转录组三维重构的方法,所述方法包括以下步骤:a. 基于X射线成像显微技术对第一植物根尖进行三维成像,获得X射线成像显微数据;b. 基于Stereo‑seq对第二植物根尖的一个或多个冷冻切片的转录组进行捕获与分析,获得所述第二植物根尖的空间组数据;c. 提取第三植物根尖的细胞核,并获得所述第三植物根尖的snRNA‑seq数据;d. 对Stereo‑seq数据和snRNA‑seq数据分别进行预处理,并将预处理后的Stereo‑seq数据和snRNA‑seq数据进行整合及注释;e. 将X射线成像显微数据与获得的整合及注释后的数据进行空间配准与整合,获得植物根尖的单细胞空间转录组三维重构图。
技术关键词
X射线成像 乙醇 冷冻切片 Louvain算法 单细胞转录组数据 真空渗透 组织 丙酮 显微技术 脱水干燥方法 条码 三维成像 基因表达数据 差异表达基因 空间坐标信息 分辨率 DNA纳米