基于perl语言的基因组组装方法、系统、设备及存储介质
申请号:CN202510720784
申请日期:2025-05-30
公开号:CN120766768A
公开日期:2025-10-10
类型:发明专利
摘要
本申请公开了基于perl语言的基因组组装方法、系统、设备及存储介质,获得高精度长Reads互作强度二维矩阵NormalForceMatrix;将二维矩阵NormalForceMatrix拆分,获得高精度长Reads的聚类结果;根据高精度长Reads的聚类结果,进行组装获得最终结果AD和STD。本申请采用一系列生物信息学手段,将单个染色体所测得的序列归为一个类群,减少其他染色体重复序列(主要来源于端粒和着丝粒)的影响,从而减少每条染色体的组装复杂度,能够有效的增加单条染色体序列的连续性(体现在组装序列的平均长度),进而得到组装质量更好的基因组图谱。
技术关键词
基因组组装方法
正态分布模型
矩阵
染色体
校正
高通量
聚类
模块
强度
位点
处理器
储存器
组装系统
理论
重复序列
元素
数据
计算机设备
数值