基于图注意力机制的肿瘤坏死因子受体序列设计模型AttenGNNDiff

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基于图注意力机制的肿瘤坏死因子受体序列设计模型AttenGNNDiff
申请号:CN202510803374
申请日期:2025-06-17
公开号:CN120673834A
公开日期:2025-09-19
类型:发明专利
摘要
本发明提供了一种基于图注意力机制的肿瘤坏死因子受体序列设计算法AttenGNNDiff,其以半径图代替K近邻图作为主链建模方式以更好地反映肿瘤坏死因子受体主链中原子分布的疏密特征,引入邻域注意力机制以提高其对肿瘤坏死因子受体局部结构特征的学习效率,结合基于注意力机制的边特征更新模块以提升边特征更新在图的特征更新中的权重,采用扩散模型框架使得其可在训练阶段学习到部分序列信息,并设计提示调优方法对模型进行调优以使得其可更好地提取肿瘤坏死因子受体同源结构域的特征,从而在肿瘤坏死因子受体蛋白质序列设计任务中展现出更强的适应性和生成能力。
技术关键词
肿瘤坏死因子受体 注意力机制 节点特征 神经网络模型 邻居 序列 坐标系 多层感知器 局部结构特征 线性变换矩阵 K近邻 调优方法 拼接边 数据 邻域