一种单细胞ecDNA克隆轨迹的识别方法

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一种单细胞ecDNA克隆轨迹的识别方法
申请号:CN202510805326
申请日期:2025-06-17
公开号:CN120656545A
公开日期:2025-09-16
类型:发明专利
摘要
本发明公开了一种单细胞ecDNA克隆轨迹的识别方法,基于ecDNA克隆特征识别单细胞ATAC数据中潜在的肿瘤标志物。本发明通过ecDNA识别癌症标志物,可以灵敏地识别肿瘤细胞并进行早期诊断;ecDNA的拷贝数、结构和分布往往在肿瘤细胞中具有较大的异质性。不同肿瘤细胞群体之间可能携带不同类型的ecDNA克隆,本发明有助于揭示肿瘤的演变轨迹及其细胞群体的多样性;本发明通过研究ecDNA的克隆轨迹,可以揭示肿瘤细胞群体在不同阶段中的基因结构变化,从而为癌症的早期筛查和监测提供潜在标志物。
技术关键词
识别方法 拷贝数 轨迹 断点 矩阵 Louvain算法 样本 非线性降维算法 数据 标记基因 对象 条形码信息 代表 可视化方法 肿瘤标志物 肿瘤微环境 染色体