基于靶向捕获测序的奶牛40K中低密度SNP芯片及其应用

本发明公开了基于靶向捕获测序的奶牛40K中低密度SNP芯片及其应用。本发明提供了用于检测奶牛基因型的芯片，包括：特异性检测SNP位点的试剂；所述SNP位点为表2中44373个SNP位点；表2中所述44373个SNP位点的位置信息是基于奶牛基因组参考序列进行比对确定的，所述奶牛基因组参考序列为Bos_taurus UMD3.1版本。与现有的30K、126K和150K芯片相比，本发明40K芯片在SNP检出率、多态性检测、个体基因型检出率、遗传评估准确性等方面检测性能一致。本发明的芯片可应用于奶牛全基因组选择以及遗传缺陷鉴定，对于后备奶牛的早期选育、母牛核心群组建、选种选配以及加快遗传进展、提升饲料管理效率具有重要意义。