摘要
本发明属于生物信息学技术领域,公开了一种病原识别与患者基因型特征的联合分析方法。本发明首先对阳性临床样本进行宏基因组测序,获取原始测序数据后,对其分别进行质控处理和数据分类,识别出致病病原体DNA序列和宿主DNA序列,之后对致病病原体DNA序列进行降噪处理,并鉴定致病病原体及其所携带的耐药基因与毒力因子,同时基于宿主DNA序列特征进行宿主基因型分析,最终获得致病病原体的组成信息、耐药基因以及毒力因子的列表和宿主基因型变异特征。本发明通过整合宿主基因变异解析流程与常规宏基因组致病病原体检测分析流程,实现对宿主和致病病原体特征的全面解析,从而提升临床诊疗的精准性和效率。