一种分子动力学约束算法的执行方法、装置、芯片及介质

本发明公开了一种分子动力学约束算法的执行方法、装置、芯片及介质，包括：GPU芯片在待处理的多个物质分子中依次确定一个分子为当前分子；获取当前分子对应的原子坐标与原子速度，根据原子坐标、原子速度以及预先确定的多个目标参数，对当前分子执行分子动力学约束算法操作；多个目标参数包括原子位置关联参数以及PV值；判断是否完成对全部分子的操作；若否，则返回执行在待处理的多个物质分子中依次确定一个分子为当前分子的操作，直至完成对全部分子的操作为止。本发明实施例的技术方案可以提高GPU芯片对分子动力学约束算法的执行效率。