摘要
本发明提出一种基于去噪扩散概率模型的空间基因表达插值方法,涉及基因数据表达领域,假设同一组织区域scRNA‑seq和ST测序数据具有相同或相似的基因表达模式。首先,通过两个马尔可夫链捕捉scRNA‑seq数据中基因表达丰度的关系:前向过程通过t个时间步向scRNA‑seq数据引入噪声,逆向过程通过基于注意力图卷积和Transformer的去噪网络恢复数据。然后将训练好的模型应用在ST数据上,在去噪过程中通过将缺失基因表达的ST数据引入,预测ST数据中缺失的部分,以补全转录组。本发明可以更加高效且准确地从scRNA‑seq参考数据中推断ST缺失的基因表达。