基于降维降采样的空间转录组细胞类型鉴注释方法

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基于降维降采样的空间转录组细胞类型鉴注释方法
申请号:CN202511095313
申请日期:2025-08-06
公开号:CN120954521A
公开日期:2025-11-14
类型:发明专利
摘要
本申请提供了一种基于降维降采样的空间转录组细胞类型鉴注释方法,涉及生物信息分析技术领域。包括以下步骤:S101,提供空间转录组基因表达矩阵和注释有细胞类型的单细胞转录组基因表达矩阵;所述细胞类型包括两个层级,第一层级为细胞大类,第二层级为细胞亚型;S102,将所述单细胞转录组基因表达矩阵按照细胞亚型拆分,同一细胞亚型的细胞聚类并生成元细胞基因表达矩阵;S103,鉴定空间转录组标志基因表达矩阵中每一空间位点的细胞大类;S104,逐一鉴定每一细胞大类下,空间转录组标志基因表达矩阵中每一空间位点的细胞亚型。本申请提供的技术方案大幅度减少分析过程的计算量,提高分析效率,增加注释的准确性和稳定性。
技术关键词
基因 注释方法 矩阵 转录组标志 位点 生物信息分析技术 单细胞转录组数据 多层感知机 层级 邻近算法 训练集 样本 检验方法 软件