基于残基关系和序列特征的蛋白-核酸结合位点识别方法

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基于残基关系和序列特征的蛋白-核酸结合位点识别方法
申请号:CN202511103200
申请日期:2025-08-07
公开号:CN120998297A
公开日期:2025-11-21
类型:发明专利
摘要
本发明公开了基于残基关系和序列特征的蛋白‑核酸结合位点识别方法,属于生物信息学技术领域。本发明结合ProtT5和ESM1b蛋白质语言模型提取的高维序列特征,以及ProtT5的多层注意力图信息,并融合氨基酸的物理化学性质特征,使得模型能够同时捕捉蛋白质序列及理化性质的丰富特征信息,从而显著提升对蛋白‑核酸结合位点的预测准确性和稳定性;通过Transformer架构增强序列特征的表达能力,并利用ProtT5的注意力图构建静态残基关系图,以捕捉残基间的相互作用信息;随后,采用图卷积网络(GCN)进行特征融合,并通过多层感知机(MLP)完成分类任务,使得模型能够充分融合不同来源的信息,提高蛋白‑核酸结合位点的预测性能和鲁棒性。
技术关键词
序列特征 理化特征 识别方法 位点 嵌入特征 矩阵 蛋白 多层注意力 关系 生物信息学技术 节点特征 消息传递机制 注意力机制 核酸复合物 构建预测模型 多层感知机 转移方法