三维分子结构生成方法和模型

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三维分子结构生成方法和模型
申请号:CN202511117932
申请日期:2025-08-11
公开号:CN120998348A
公开日期:2025-11-21
类型:发明专利
摘要
本申请公开了一种三维分子结构生成方法和模型,涉及计算化学与机器学习交叉技术领域,三维分子结构生成方法包括:基于分子拓扑信息,采用预设的距离几何算法结合预设的分子力场优化生成初始三维构象;根据初始三维构象和分子拓扑信息构建三路SE(3)等变几何图,并基于各SE(3)等变几何图生成各图的等变节点表示;对各SE(3)等变几何图各自的等变节点表示进行融合,得到分子嵌入;根据分子嵌入和预设的DFT真值坐标预测原子坐标偏移量;根据初始三维构象和原子坐标偏移量生成目标三维分子结构。本申请能够在有限计算资源和数据规模下实现高精度、高效率和强鲁棒性的三维构象预测。
技术关键词
生成方法 编码器模块 分子 坐标 机器学习交叉技术 节点 解码模块 多头注意力机制 矩阵 共价键 算法 误差 鲁棒性 线性 高效率 度量 规模 偏差 关系