一种小分子跨膜渗透自由能计算方法和数据集建立方法

本发明提供了一种小分子跨膜渗透自由能计算方法和数据集建立方法，属于自由能计算技术领域。所述小分子跨膜渗透自由能计算方法通过分子键网络算法对小分子进行粗粒化参数化处理，构建水‑膜体系，并利用分子动力学模拟软件进行拉伸动力学模拟和伞状采样模拟，从而得到化合物渗透跨膜过程的自由能变化曲线与水‑膜分配自由能。不仅显著节约了实验时间，还能够生成大批量、高质量的跨膜渗透能力数据。所述小分子跨膜渗透自由能数据集建立方法，通过化学特征空间进行分子的筛选，使得数据集适用范围广、代表性强。使用该数据集训练的药物跨膜自由能预测模型能够更准确地预测药物的跨膜能力，为药物研发提供科学依据。