基因大模型与ML联合鉴定Cas靶点有效性的方法

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基因大模型与ML联合鉴定Cas靶点有效性的方法
申请号:CN202511131013
申请日期:2025-08-13
公开号:CN120636549B
公开日期:2025-11-11
类型:发明专利
摘要
本发明公开了一种基因大模型与ML联合鉴定Cas靶点有效性的方法,属于生物技术和人工智能领域。方法包括:构建A种联合序列以及靶向联合序列的检测阵列,检测阵列具有A个检测单元;在每个检测单元中分别加入一种联合序列,进行孵育反应,获取各个检测单元的荧光值并进行归一化处理;对各联合序列采用特征提取模型进行关键特征提取;构建标签集和训练集,构建集成模型并采用标签集和训练集进行训练;将特征提取模型与训练好的集成模型组成机器学习模型;对于新的靶标序列和PAM序列,将其结合为待分析的联合序列,再输入机器学习模型,得到预测荧光值,基于荧光值判断Cas蛋白对联合序列的识别能力。本发明可助力靶向治疗检测。
技术关键词
特征提取模型 机器学习模型 深度学习模型 蛋白 有效性 荧光探针 支持向量回归模型 正则化参数 基因 构建训练集 复合体 靶标 重复序列 靶向治疗 阵列 随机森林 处理器