一种基于SNP位点的四倍体长牡蛎亲子关系鉴定方法

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一种基于SNP位点的四倍体长牡蛎亲子关系鉴定方法
申请号:CN202511282083
申请日期:2025-09-09
公开号:CN120758646A
公开日期:2025-10-10
类型:发明专利
摘要
本发明公开了一种基于SNP位点的四倍体长牡蛎亲子关系鉴定方法,属于四倍体长牡蛎分子辅助育种技术领域。该四倍体长牡蛎亲子关系鉴定方法包括以下步骤:(1)取待测四倍体长牡蛎的闭壳肌进行测序;(2)比对长牡蛎参考基因组,获取四倍体长牡蛎指定SNP位点的基因型;(3)根据SNP分型结果计算所有待测亲本和子代的IBS和LOD;(4)结合IBS和LOD鉴定待测亲本和子代的亲子关系。本发明的有益之处在于:本发明首次公开了1000个用于四倍体长牡蛎亲子关系鉴定的SNP位点,为四倍体长牡蛎亲子关系鉴定提供了数据支撑,并为四倍体长牡蛎亲子关系鉴定液相芯片的开发打下基础,具有良好的应用前景。
技术关键词
四倍体 亲本 牡蛎 染色体 位点 分子辅助育种 频率 液相 芯片 数据