确定生物体病状的基因标志物、检测模型的构建方法和检测装置
申请号:CN202411462075
申请日期:2024-10-18
公开号:CN119391852A
公开日期:2025-02-07
类型:发明专利
摘要
本发明涉及一种确定生物体病状的基因标志物、检测模型的构建方法和检测装置,所述确定生物体病状的基因标志物是由参考基因组上的k个连续的碱基序列构成,所述碱基序列是由游离脱氧核糖核酸(cfDNA)的5’端断点处比对至参考基因组上的位置向上游间隔n个bp碱基后延长k个bp而获得的3’end motif的碱基序列集合。本申请发明人在长期研究中发现游离脱氧核糖核酸(cfDNA)片段3’端固定长度碱基序列集合即3’end motif变化也将体现出不同核酸酶活性的变化,能够成为确定生物体病状的新的生物标志物,与5’end motif和breakpoint motif一起完善游离脱氧核糖核酸(cfDNA)片段末端序列特征体系。并且与5’end motif和breakpoint motif相比,3’end motif作为确定生物体病状的基因标志物,有着更加优秀的分类效果。
技术关键词
碱基序列数据
脱氧核糖核酸
基因
诊断试剂盒
计算机存储设备
样本
输入模块
分类器模型
输出模块
生物标志物
待测对象
序列特征
断点
风险
频率
算法